调控性非编码RNA以及微型生物信息分析平台构建学习班

2017年11月25-26日 上海

课程背景

长期以来，研究人员对基因组的关注主要集中在蛋白质编码基因和蛋白质本身，大数据的积累，揭示出人类和其他高等真核生物的遗传物质只有一小部分编码蛋白质，大量的转录产物是功能多样性的RNA分子，其中就包括调控性非编码RNA（non-coding RNA, ncRNA）。目前ncRNA研究已是当今生命科学领域发展最迅速的前沿领域之一，尤其是microRNA（miRNA）、长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA），环状RNA（circularRNA，circRNA）等。调控性非编码RNA可以通过DNA水平、转录前水平、转录水平、转录后水平、翻译和翻译后水平等途径来调控基因的表达。非编码RNA的挖掘一方面可以通过自己设计实验，通过高通量测序以及随后的生物信息学大数据分析，另一方面也可以利用公共数据资源，围绕自己的课题进行相应的生物信息学分析。非编码RNA研究将从全新角度揭示生命调控的分子机制，并为人类疾病的诊断和防治提供理论依据和新的技术。

课程内容、目标与特色与讲师

本次学习提供了一次系统了解调控性非编码RNA的生成机制，调控类型等生物科学知识前沿，也提供了微型生物信息学平台搭建方法和使用技巧，以便为自身科研项目服务。本次学习涵盖拟解决的问题包括：1、调控性非编码概述。2、调控性非编码RNA数据库数据库介绍。3、非编码RNA研究的微型生信平台搭建。4、圈图在非编码RNA中的应用。本次学习老师专注于生物信息学研究十余年，长期活跃于科研一线，熟悉调控性ncRNA的研究现状和研究策略，具有扎实的理论基础和丰富的生物数据处理经验。

课程目录

本次学习班将结合上机实际操作，对非编码RNA文章写作和数据深入挖掘进行详细介绍；协助构建微型生物信息分析平台，并对Linux操作系统、R语言作图、perl语言和Circos作图进行系统性学习。

一：调控性非编码RNA概述（第一天上午）

1.1， 调控性非编码RNA概念及重要分类

1.2， 调控性非编码RNA的来源和生成机制

1.3， 调控性非编码RNA的调控模式

1.4， 调控性非编码RNA的研究意义

1.5， 调控性非编码RNA的发现（高通量测序）

二：调控性非编码RNA数据库和案例分析（第一天下午）

2.1， microRNA: mirbase,targetscan, mirtarbase, RNAhybrid

2.2， lncRNA:rdpdb, lncRNAdb, LNCipedia

2.3， circRNA:circBase, CircInteractome, circRNADb

三：非编码RNA研究的微型生信平台搭建（第二天上午）

3.1， linux环境熟悉（cygwin安装，基本linux命令）

3.2， perl语言学习（perl和bioperl安装，利用bioperl从数据库下载序列）

3.3， R语言作图（R包安装，利用pheatmap绘制热图）

四：圈图在非编码RNA中的应用（第二天下午）

4.1， 文献中的圈图

4.2， 微型生信平台中安装circos

4.3， circos绘制圈图

五：讨论和答疑（第二天下午）

主办单位：

上海玮瑜生物科技有限公司  上海服淡信息科技有限公司

时间地点：

2017年11月25日-26日  24日报到  田林宾馆  (徐汇区田林路1号)

住宿酒店：

田林宾馆：标准间380元/间   合住190元/间  

注册费用：

   2600元/人。授课期间发放纸质邀请函（盖章）和发票。按交费先后顺序确定座位号。会务期间提供午餐，晚餐自理。

报名方式：

请将回执表复制后填写发送到exosomewy@163.com,  邮件主题注明调控性非编码RNA以及微型生物信息分析平台构建学习班

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